Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Hecw1Q8K4P8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hecw1Q8K4P8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Hecw1Q8K4P8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Hecw1Q8K4P8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms