Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ltbp4Q8K4G1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ltbp4Q8K4G1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ltbp4Q8K4G1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms