Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f2Q8K3M1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdh16f2Q8K3M1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f2Q8K3M1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms