Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk5rap2Q8K389 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdk5rap2Q8K389 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk5rap2Q8K389 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms