Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nsl1Q8K305 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nsl1Q8K305 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms