Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prpf39Q8K2Z2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Prpf39Q8K2Z2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Prpf39Q8K2Z2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms