Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stn1Q8K2X3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stn1Q8K2X3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms