Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brd3Q8K2F0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brd3Q8K2F0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brd3Q8K2F0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms