Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd300eQ8K249 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd300eQ8K249 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms