Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne5Q8JZW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpne5Q8JZW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpne5Q8JZW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms