Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rasgef1bQ8JZL7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rasgef1bQ8JZL7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms