Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip10Q8CJ53 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trip10Q8CJ53 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms