Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LgsnQ8CIX8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LgsnQ8CIX8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms