Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Upp2Q8CGR7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Upp2Q8CGR7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 365.4 ms