Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcerg1Q8CGF7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcerg1Q8CGF7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcerg1Q8CGF7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
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