Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Bola3Q8CEI1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bola3Q8CEI1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms