Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp27Q8CEG8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Usp27Q8CEG8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Usp27Q8CEG8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp27Q8CEG8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp27Q8CEG8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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