Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
9030612E09RikQ8CE20 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
9030612E09RikQ8CE20 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms