Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc17Q8CE13 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc17Q8CE13 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms