Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc178Q8CDV0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc178Q8CDV0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc178Q8CDV0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms