Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc87Q8CDL9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc87Q8CDL9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc87Q8CDL9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms