Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Riox2Q8CD15 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Riox2Q8CD15 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Riox2Q8CD15 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms