Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Bhlhe22Q8C6A8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Bhlhe22Q8C6A8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Bhlhe22Q8C6A8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms