Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5C9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C5C9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q8C5C9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8C5C9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Q8C5C9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8C5C9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8C5C9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q8C5C9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q8C5C9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C5C9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C5C9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C5C9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C5C9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C5C9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C5C9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q8C5C9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q8C5C9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q8C5C9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q8C5C9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C5C9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C5C9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C5C9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q8C5C9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q8C5C9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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