Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skor1Q8BX46 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Skor1Q8BX46 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Skor1Q8BX46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms