Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ube3dQ8BX13 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ube3dQ8BX13 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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