Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp5Q8BX09 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp5Q8BX09 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms