Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ctdsp2Q8BX07 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctdsp2Q8BX07 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctdsp2Q8BX07 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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