Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
5730596B20RikQ8BQ08 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms