Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ckap4Q8BMK4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ckap4Q8BMK4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms