Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hirip3Q8BLH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hirip3Q8BLH7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms