Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp54Q8BL06 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Usp54Q8BL06 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp54Q8BL06 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.9 ms