Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gpc2Q8BKV1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gpc2Q8BKV1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpc2Q8BKV1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms