Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tnrc6bQ8BKI2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tnrc6bQ8BKI2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 634.1 ms