Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prune1Q8BIW1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prune1Q8BIW1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prune1Q8BIW1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms