Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4bQ8BGE6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4bQ8BGE6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4bQ8BGE6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4bQ8BGE6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4bQ8BGE6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atg4bQ8BGE6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg4bQ8BGE6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg4bQ8BGE6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms