Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Katnb1Q8BG40 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Katnb1Q8BG40 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms