Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg4cQ811C2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atg4cQ811C2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Atg4cQ811C2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Atg4cQ811C2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Atg4cQ811C2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Atg4cQ811C2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg4cQ811C2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms