Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc172Q810N9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc172Q810N9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc172Q810N9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms