Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ChfrQ810L3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ChfrQ810L3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms