Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ell3Q80VR2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ell3Q80VR2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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