Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Aldh3b1Q80VQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms