Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms