Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc29Q80VM3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Ttc29Q80VM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ttc29Q80VM3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Ttc29Q80VM3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc29Q80VM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
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