Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc155Q80VJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc155Q80VJ8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms