Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Otop3Q80UF9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otop3Q80UF9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms