Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cul9Q80TT8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cul9Q80TT8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cul9Q80TT8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cul9Q80TT8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms