Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
NischQ80TM9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC41.79■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
NischQ80TM9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC41.7■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NischQ80TM9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
NischQ80TM9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC41.64■■■■■ 4.26
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