Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Znf516Q7TSH3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Znf516Q7TSH3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms