Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dsg1cQ7TSF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dsg1cQ7TSF0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms