Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prrc2aQ7TSC1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prrc2aQ7TSC1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms